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子宫内膜异位症大多为良性病变，但极少数情况下可能恶变为癌症，常见于卵巢子宫内膜异位囊肿（巧克力囊肿）。研究显示，内异症相关卵巢癌风险较普通人群略高，尤其是长期存在的囊肿（直径超过8厘米）、绝经后内异症症状突然加重，或超声提示囊肿内有实性成分、乳头状突起时，需警惕恶变可能。

恶变通常与异位内膜长期受雌激素刺激、局部炎症反复发作导致细胞异常增生有关。若出现痛经性质改变（如由胀痛转为锐痛）、非经期异常出血、盆腔包块快速增大伴消瘦乏力，应立即就医。通过超声、肿瘤标志物（如CA125、HE4）及腹腔镜活检可明确诊断。早期发现并手术切除病灶联合化疗，能显著提高预后。定期随访监测囊肿变化是预防恶变的关键，患者需重视身体异常信号。