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子宫内膜异位症可能影响怀孕，但并非绝对不孕。轻度患者卵巢功能正常、盆腔粘连较轻时，仍有自然受孕可能。但中重度患者因异位内膜在盆腔形成粘连，可能包裹卵巢或输卵管，阻碍卵子排出或精卵结合。若异位灶种植在卵巢形成巧克力囊肿，会破坏卵巢组织，降低卵子质量与数量。

盆腔炎症环境还会干扰输卵管蠕动功能，使受精卵难以顺利进入子宫，增加宫外孕风险。研究表明，内异症患者不孕率较普通人群高30%-50%。若备孕超过一年未成功，尤其伴随痛经、性交痛等症状，建议通过腹腔镜检查评估内膜异位程度，术后结合药物调理或辅助生殖技术，可提高受孕几率。